Прототипът на въздушния филтър е устройство за защита на дишането, което хората използват, за да предпазят дишането си. Според записите още през първи век в Рим хората са използвали маска, направена от коноп, за да ги предпази, когато пречистват живак. През дългото време оттогава въздушните филтри също постигнаха напредък, но те се използват главно като уреди за дихателна защита в някои опасни индустрии, като например производството на опасни химикали. През 1827 г. Браун открива законите на движение на малки частици и хората разбират по-добре механизма на филтриране на въздуха.
Бързото развитие на въздушните филтри е тясно свързано с развитието на военната индустрия и електронната индустрия. По време на Първата световна война, поради използването на различни химически агенти, се появяват военните противогази, използващи филтърна хартия от азбестови влакна като филтърен слой за дим. Филтърната среда от стъклени влакна е патентована в Съединените щати през октомври 1940 г. През 50-те години Съединените щати провеждат-задълбочени изследвания върху производствения процес на филтърна хартия от стъклени влакна, което подобрява и развива въздушния филтър. През 60-те години се появиха HEPA филтри; през 70-те години на миналия век, HEPA филтрите, използващи филтърна хартия от микро-стъклени влакна като филтърна среда, ефективността на филтриране на частици с размер на частиците от 013 микрона достига до 99,9998%. От 80-те години на миналия век, с появата на нови методи за изпитване, подобрена оценка на употребата и повишени изисквания за производителност на филтриране, беше установено, че HEPA филтрите имат сериозни проблеми, така че те произвеждат ULPA филтри с по-висока-производителност. Страните все още работят по изследвания и се очаква скоро да бъдат налични по-усъвършенствани въздушни филтри.